1949年1月，中国人民解放军粤赣湘边纵队成立，原粤赣边支队，改为粤赣湘边纵队东江第二支队。后魏南金调纵队政治部工作，为代主任，东二支队郑群为司令员，钟俊贤为政委，黄中强仍任政治部主任，曾志云仍任参谋长。

魏南金同志既有坚定的原则性又讲究斗争的策略，注意运用统一战线政策，分化和瓦解敌人。如在参与指挥解放老隆的战役中，他采取攻心为上的策略，参与策划了保十三团起义并取得了解放老隆及老隆战役的胜利。当时，中共九连地委领导集体及严尚民、魏南金、钟俊贤、郑群等根据粤赣湘边区党委指示，共同策划国民党广东省保安第十三团起义。经过多次谈判，保十三团决定弃暗投明，选择了起义的道路，于1949年5月14日在老隆宣布起义。我军与起义部队共同作战，全歼保安第四师师部和消灭增援老隆的保五团。同日粤赣湘边纵队东江第二支队独立第二大队奉命进驻佗城，接收国民党县政府。龙川宣告解放，是广东省较早解放的县份。按上级指示，魏南金以边纵政治部代主任的身份筹备成立中共龙川县委员会，并兼任县委书记。1949年6月1日，龙川县人民政府宣告成立（县城在老隆)。魏兼任县长，郑子明、骆仰文为副县长。在县政府成立大会上，魏偕新政府班子宣誓就职，并发表施政讲话。他说，龙川县人民政府施政的基本精神，就是依据为龙川县人民服务的原则，领导全县人民跟一切恶势力作斗争。当前的主要任务是:第一，建立县以下各级政权机构；第二，发动全县人民大力支援前线,做好迎接南下大军的准备工作；同时成立政工队，深入各区、乡、村进行宣传工作。希望每个龙川人民都了解人民政府所执行的各项政策；第三，将活跃在龙川北部、中部、南部的游击队全部集中整编为龙川公安总队，实行统一领导和指挥，以夺取新的更大的胜利。关于教育方面，为了贯彻党的教育方针，7月召开全县教师会议，举办师资训练班等等。

老隆解放后，国民党龙川自卫总队长黄道仁率残部逃到龙母，与当地的谢鸿恩部汇合，准备顽抗到底。7月中旬，魏南金奉命为总指挥，抽调边纵主力四团(原东二支主力三团)一营和龙川公安总队协同作战，全歼黄道仁、谢鸿恩部，取得了龙母战斗的胜利。龙母大捷是老隆战役的最后一战，标志龙川境内国民党势力全部被歼灭，影响很大。魏南金等前线指战员受到粤赣湘边纵队通令嘉奖。

魏南金兼任中共龙川县委书记、县长仅两个多月，就奉命执行边纵政治部代主任的任务，率部北上，迎接并配合南下大军解放广州。